Sistema informático para la anotación genética de origen probiótico (Probiogenómica)
TecnologíaEste sistema informático se materializa en un software que permite seleccionar, caracterizar y ranquear atributos benéficos de bacterias probióticas a través del análisis de su genoma. Esta herramienta realiza una búsqueda de marcadores genéticos que son asociados a características probióticas benéfica, las que encuentran ampliamente caracterizadas en bases de datos internacionales (p ej. Genbank del National Center for Biotechnology Information). Adicionalmente, el sistema permite distinguir proteínas de alto valor biológico producidas por bacterias probióticas, las que pueden ser destinadas a tratamientos contra enfermedades específicas o aplicaciones distintas a la salud humana. Por lo tanto, este proceso facilita la dirección de esfuerzos de caracterización y validación de probióticos con aplicaciones particulares, puesto que permite definir un ranking de aquellas cepas que poseen características benéficas específicas para alguna patología. Adicionalmente, la herramienta permite distinguir modificaciones o mutaciones del genoma de bacterias clonadas desde probióticos originales, permitiendo distinguir fácilmente que provienen de su linaje. La tecnología permite generar dos modelos de negocio: * Disponibilización del sistema como un SAAS que permita caracterizar en línea los genomas de bacterias y describir la ontología de regiones con capacidad probiótica. * Generar un portafolio de cepas probióticas con funcionalidades específicas.
Qué problema resuelve esta capacidad
La tecnología permite realizar un análisis bioinformático de las posibles interacciones que puede generar la bacteria probiótica con el huésped, requiriendo sólo su secuencia genómica. El término utilizado para describir esta aplicación es **Probiogenómica** , acuñado por Marco Ventura (2007). Lo anterior tiene como ventajas la capacidad de **realizar una preselección de la funcionalidad de la cepa probiótica** en función de su caracterización molecular. Lo anterior permite dirigir los ensayos de laboratorio y clínicos, **ahorrando con esto recursos y dedicación de personal calificado**. Se ha demostrado que los probióticos procesan fármacos y otras biomoléculas generando poli-farmacología que afecta a múltiples receptores. Esta área de estudio es relativamente nueva y podría ser la clave para determinar nuevas cinéticas farmacológicas, interacciones huésped-microbiota y mecanismos para tratamiento de enfermedades complejas, complementando con la administración de prebióticos. En la actualidad se han analizado todas las secuencias probióticas disponibles con el proyecto crea y valida en curso y se proyecta comparar estas secuencias con la anotación que existe de genes asociados a la inmunomodulación.
Cuáles son las ventajas competitivas de esta capacidad
* Análisis in sílico de capacidades probióticas, que resulta rápido, económico y eficiente. * Código fuente propio, innovador y sujeto a mejoras en velocidad de respuesta y capacidad de clasificación. * Alta correlación de resultados de clasificadores con ensayos in vitro. * Permite identificar el linaje de clones bacterianos, permitiendo distinguir fácilmente regiones genéticas que han sido modificadas. * Permite realizar mapas de aplicación para probióticos. * Se puede implementar como un SAAS, en el que los clientes ingresan la secuencia del genoma bacteriano y la herramienta realiza el análisis automatizado de los potenciales sitios que poseen características probióticas relevantes. * Inicialmente está planteado para ser utilizado en medicina humana, aunque podría ser adecuado prontamente para analizar probióticos de uso veterinario.
Qué más deberías saber sobre esta capacidad
TRL 5
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Alexis Marcelo Salas BurgosRegístrate y accede directamente al contacto
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